.ssh/config
に以下のような記載をすればOKです。
-----------------------
Host github.com HostName ssh.github.com Port 443 ProxyCommand /usr/bin/ncat --proxy <server>:<port> --proxy-type http %h %p-----------------------
ssh -T git@github.com
で接続できることを確認したらgitも利用できるはずです。
以下を参考にさせていただきました。
https://qiita.com/n_slender/items/30db800aad7eb193c07e
https://qiita.com/vvisteria/items/bd748406671faae228cb